تهتم إدارة المعهد بالنواحي التطبيقية، وذلك بتفعيل دور المختبر؛ أسوة بعلمائنا المسلمين الذين استندوا إلى الملاحظة الحسية والتجربة العلمية بعيداً عن الغموض والإبهام والطلاسم والمعميات، وقد حصل المعهد على المرتبة الأولى بين مدارس فلسطين في معرض فلسطين للعلوم والتكنولوجيا في اختراع مصدٍّ مرن واقٍ للسيارة من الجزء الأمامي والخلفي، وبهذا الاختراع مثلّت مدرسة المعهد فلسطين في معرض «انتل الدولي» في الولايات المتحدة الأمريكية . ونأمل توسيع المختبر وتحديث أجهزته بما يتناسب والمستجدات الحديثة في التربية وطرائقها.